影响紫外线杀菌效果的因素主要有灯管的功率，水流速度即水体在壳体内停留时间。水层受辐射的距离。
紫外线灯管的功率随着使用时间的增加其辐射能量随着降低，杀菌效果下降，灯管使用时间到2000h，发射强度下降25%左右，使用时间为10000h，发射强度只有额定的55%左右。为保证产品质量，紫外灯管使用时间到1000h后应及时调换新灯管。
应保证供电电压的稳定以使辐射能量的稳定。
当水流量一定时，过流面积大，水流速度慢，水体在壳体内有足够长的停留时间，有利于杀菌。但是，壳体直径越大，水层厚度也越厚，离灯管的距离也就越远，杀菌效果也就差。据资料介绍30W紫外灯对1cm的水层灭菌效率为90%，对4cm水层灭菌效率只有40%左右。为保证水体在壳体内有足够的停留时间，又不致水层过厚，可在壳体内加装折流板以提高灭菌效果。
